156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4316 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 332 aa  669    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  27.67 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  31.79 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  27.25 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  27.5 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.2 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  27.89 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.67 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  29.87 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  28.45 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  30.79 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.67 
 
 		 346 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  28.15 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  24.25 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  27.86 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  28.45 
 
 		 336 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  29.31 
 
 		 338 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.54 
 
 		 348 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.11 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.8 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.52 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  28.62 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.85 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.17 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.9 
 
 		 338 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  28.03 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.63 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.34 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  27.94 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  24.85 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  28.39 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.73 
 
 		 419 aa  92.8  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.75 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.75 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  22.5 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  29.2 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  23.44 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  23.44 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  26.16 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  24.06 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  31.35 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  24.33 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  24.18 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  22.85 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  21.75 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  24.65 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.82 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  20.43 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  26.26 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  22.73 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  24.06 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.82 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  24.45 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  22.18 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  20.8 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  21.17 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  23.75 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  20.91 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  23.64 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 348 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  20.8 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0703  DNA polymerase III, delta subunit  23.45 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000446236  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  26.57 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.2 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  22.81 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  18.02 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  23.49 
 
 		 341 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  20.25 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  24.88 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.13 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.73 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  26.44 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  24.13 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  22.12 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  23.13 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  21.14 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0457  DNA polymerase III, delta subunit  24.05 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0617  DNA polymerase III, delta subunit  24.05 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.733396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0513  DNA polymerase III, delta subunit  26.92 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  22.36 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1185  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 341 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0999  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 343 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.119076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  24.45 
 
 		 328 aa  52.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  23.95 
 
 		 331 aa  52.8  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3146  DNA polymerase III subunit delta  25.36 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  21.67 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  19.12 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>