100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1185 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 337 aa  660    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  29.39 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.99 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.16 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  27.18 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  29.52 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  23.94 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.56 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  22.82 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  21.95 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.78 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  25.25 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  20.88 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  25.25 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.32 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  22.3 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  21.19 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  22.64 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  22.09 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  22.7 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  22.98 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.94 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2981  DNA polymerase III subunit delta  19.67 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  24.65 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2571  DNA polymerase III subunit delta  19.34 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225423  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.88 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  20.91 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0577  DNA polymerase III subunit delta  19.41 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0623  DNA polymerase III subunit delta  20.51 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  22.47 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0656  DNA polymerase III subunit delta  19.78 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121282  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0551  DNA polymerase III subunit delta  19.41 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0556298  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0173  DNA polymerase III subunit delta  19.78 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  23.47 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  23.77 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3449  DNA polymerase III subunit delta  18.68 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.785603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0368  DNA polymerase III subunit delta  18.68 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1227  DNA polymerase III subunit delta  18.68 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3413  DNA polymerase III subunit delta  18.68 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3448  DNA polymerase III subunit delta  18.68 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2638  DNA polymerase III subunit delta  18.68 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2742  DNA polymerase III subunit delta  19.05 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2451  DNA polymerase III subunit delta  18.68 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  22.83 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.61 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.38 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  33 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  22.59 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  20.54 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2730  DNA polymerase III subunit delta  18.68 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.969457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25.09 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  22.71 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  21.35 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  20.76 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  19.93 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  19.93 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  20.82 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  19.93 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  25.96 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  20.18 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  24.75 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  20.33 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  20.68 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  21.9 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.06 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.06 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.06 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  22.37 
 
 		 345 aa  50.4  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.06 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.06 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.06 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.06 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  19.79 
 
 		 351 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.33 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.33 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  21.19 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0513  DNA polymerase III, delta subunit  21.27 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2971  DNA polymerase III subunit delta  17.49 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0578  DNA polymerase III subunit delta  17.95 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  19.4 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.33 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  21.3 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0256  DNA polymerase III, delta subunit  19.03 
 
 		 353 aa  46.2  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3378  DNA polymerase III subunit delta  16.48 
 
 		 372 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.930897  hitchhiker  0.00000000672182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  20.09 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0234  DNA polymerase III, delta subunit  18.08 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  20.36 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  20.65 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0671  DNA polymerase III, delta subunit  20.88 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00374825  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  21.66 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1508  DNA polymerase III, delta subunit  20.88 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0182978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  18.83 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.52 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  21.6 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  22.39 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  24.26 
 
 		 331 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1189  DNA polymerase III, delta subunit  20 
 
 		 331 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.725755  normal  0.332691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>