219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1004 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
348 aa  691    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  65.18 
 
 
344 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  46.87 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  47.76 
 
 
336 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  47.76 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  47.76 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  47.76 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  47.76 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  47.76 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  47.76 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  47.76 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  46.87 
 
 
336 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  47.46 
 
 
336 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  36.65 
 
 
343 aa  199  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  33.65 
 
 
324 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  33.65 
 
 
324 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  32.5 
 
 
324 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  30.82 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  30.51 
 
 
331 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  29.75 
 
 
334 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  33.79 
 
 
333 aa  153  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  30.7 
 
 
329 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  30.06 
 
 
329 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  33.86 
 
 
335 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  30.06 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  29.27 
 
 
337 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  29.27 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  30.7 
 
 
334 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  26.61 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.61 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  29.79 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  25.27 
 
 
378 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  28.08 
 
 
336 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  30.49 
 
 
336 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  29.85 
 
 
338 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  26.9 
 
 
341 aa  125  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 
344 aa  122  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  28.87 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  28.89 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  30.72 
 
 
344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  27.54 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  30.03 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  26.38 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  29.47 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  27.71 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.69 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  26.93 
 
 
325 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 
330 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  28.01 
 
 
354 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  27.04 
 
 
332 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  25.4 
 
 
334 aa  105  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  24.85 
 
 
334 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  24.48 
 
 
329 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.87 
 
 
339 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25.39 
 
 
341 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  29.81 
 
 
336 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  27.3 
 
 
350 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  23.39 
 
 
338 aa  99.8  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  26.23 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  24.44 
 
 
374 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  23.38 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  26.56 
 
 
338 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  27.22 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 
419 aa  90.5  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  23.56 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  25.5 
 
 
399 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  21.57 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  21.57 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  26.2 
 
 
344 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  22.44 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  29.37 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  28.25 
 
 
345 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  27.33 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  19.5 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  23.29 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  28.46 
 
 
345 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  27.74 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  27.41 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  23.7 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  26.02 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  29.17 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  26.12 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.65 
 
 
328 aa  69.3  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  27.16 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  24.44 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.89 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  28.24 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.16 
 
 
306 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  21.81 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  26.1 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.3 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  24.19 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  26.96 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>