97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07750 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 330 aa  674    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  55.87 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  50.16 
 
 		 327 aa  311  9e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  38.76 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  27.1 
 
 		 332 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.52 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.35 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.81 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.33 
 
 		 331 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.18 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.08 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.08 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.08 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.08 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24.76 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.76 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.76 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24.76 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24.76 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.57 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.34 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  24.42 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  26.38 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.57 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  26.21 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.1 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  27.97 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  22.65 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25.99 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.3 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.11 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  25.75 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.82 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.75 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.05 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  26.82 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  24.65 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.09 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.29 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  21.82 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.41 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  25.72 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  20.92 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.55 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  25.39 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  21.9 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  26.37 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  29.52 
 
 		 342 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  26.25 
 
 		 326 aa  52.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  27.46 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2928  DNA polymerase III subunit delta  25.52 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1844  DNA polymerase III subunit delta  25.52 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3017  DNA polymerase III subunit delta  25.52 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336067  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.27 
 
 		 419 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  19.74 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  29.03 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.83 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  19.93 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  19.93 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  24.6 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  27.01 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  28.97 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.31 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  19.82 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  22.61 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  23.22 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  17.73 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  23.22 
 
 		 327 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1185  DNA polymerase III subunit delta  22.73 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  33.33 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  20.06 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  21.56 
 
 		 349 aa  46.2  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  26.56 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  28.32 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  21.9 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  25.7 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0476  DNA polymerase III subunit delta  24.37 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.159232  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3146  DNA polymerase III subunit delta  22.35 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2931  DNA polymerase III, delta subunit  23.39 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118412  decreased coverage  0.00725914 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  19.75 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  23.44 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  26.82 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1205  DNA polymerase III subunit delta  23.32 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  27.85 
 
 		 336 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  23.76 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  23.76 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  26.37 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  23.5 
 
 		 465 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  24 
 
 		 465 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  21.95 
 
 		 346 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>