136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2973 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 324 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  62.1 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  56.83 
 
 		 354 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  42.86 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  33.44 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  34.49 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  31.25 
 
 		 331 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  30.79 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  32.18 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  32.29 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  29.56 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  33.45 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  29.12 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  29.69 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  32.39 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  27.4 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  29.12 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  31.33 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  27.94 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  31.41 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  30.03 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  29.43 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  29.43 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  25.4 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  29.43 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.11 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  29.43 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  29.11 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  29.11 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  29.11 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  29.11 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  34.09 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  29.11 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  26.93 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  29.47 
 
 		 348 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  26.25 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  28.62 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.8 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  27.04 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  24.45 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  29.73 
 
 		 338 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  26.43 
 
 		 331 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  24.37 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  24.37 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  27.09 
 
 		 328 aa  92.4  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  25.15 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  24.85 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.39 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  23.75 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  29.89 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  22.5 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.46 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  24.59 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.57 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25.72 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.09 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  27.69 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  23.26 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  27.96 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  27.14 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  25.17 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  20.88 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  23.69 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.88 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.05 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  27.11 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  26.93 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  27.11 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  23.1 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  26.82 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  26.51 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  27.75 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  27.04 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  26.02 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  29.35 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  31.98 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  23.85 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  22.93 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  25.94 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  30.77 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  31.84 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  31.33 
 
 		 465 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  31.33 
 
 		 465 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  31.33 
 
 		 465 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  29.71 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  29.44 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  21.55 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  26.4 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  26.13 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  23.15 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  27.06 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  29.39 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  23.74 
 
 		 329 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  22.71 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>