90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0803 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 323 aa  666    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  37.74 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  36.92 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  38.76 
 
 		 330 aa  196  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.94 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.94 
 
 		 329 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.34 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  23.01 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  25.49 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  23.27 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.47 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  24.05 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  21.56 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.63 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.12 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.67 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.67 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  23 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  23 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  23 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  23 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.94 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.67 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  22.19 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.66 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.67 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.05 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  22.98 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.64 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  21.66 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.77 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.7 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.2 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  24.16 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  22.14 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  22.97 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.13 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.86 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  23.17 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  26.83 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  20.92 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  24.83 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  22.1 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  21.78 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  21.78 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  22.14 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.39 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  15.81 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  27.34 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  21.54 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  23.08 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  25.76 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  25.42 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1205  DNA polymerase III subunit delta  23.89 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.634211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3017  DNA polymerase III subunit delta  23.99 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1844  DNA polymerase III subunit delta  23.99 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2928  DNA polymerase III subunit delta  23.99 
 
 		 344 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1185  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  21.23 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  21.19 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  22.13 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  21.23 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  21.2 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  20.58 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  20.37 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  22.67 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  19.93 
 
 		 324 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  29.32 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  18.97 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.11 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  20.4 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  24.65 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  24.65 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.43 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  24.65 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  21.29 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  22.54 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  21.07 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  28.03 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  20.94 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  23.56 
 
 		 419 aa  42.7  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>