71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3846 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 326 aa  635    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  92.94 
 
 		 326 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  57.74 
 
 		 319 aa  338  8e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  55.41 
 
 		 319 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  53.82 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  53.77 
 
 		 322 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  49.84 
 
 		 326 aa  288  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  50.79 
 
 		 325 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  48.08 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  50.48 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  48.76 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  50.31 
 
 		 334 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  50.76 
 
 		 335 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  48.21 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  47.59 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  46.91 
 
 		 320 aa  245  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  46.91 
 
 		 320 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  46.91 
 
 		 320 aa  245  9e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  45.31 
 
 		 317 aa  242  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  46.37 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  46.58 
 
 		 319 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  44.23 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  40.84 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  48.7 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  42.63 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  44.84 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  43.01 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  41.04 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  40.63 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  42.77 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  42.86 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  41.53 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  39.38 
 
 		 342 aa  184  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  39.62 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  38.85 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  37.65 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  33.75 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  29.25 
 
 		 348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.52 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.52 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.31 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.98 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.1 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.58 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.65 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.31 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  25.93 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.84 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  21.2 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.22 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.02 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  26.64 
 
 		 338 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  27.99 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.19 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  28.47 
 
 		 345 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  28.47 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  21.54 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  28.82 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  21.47 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  28.42 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  30.26 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  31.91 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  29.01 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  27.84 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.85 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  21 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>