86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1551 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 329 aa  635    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  54.82 
 
 		 326 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  58.2 
 
 		 322 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  53.18 
 
 		 326 aa  315  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  52.88 
 
 		 319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  53.82 
 
 		 326 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  52.27 
 
 		 330 aa  301  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  50.31 
 
 		 319 aa  281  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  49.53 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  50 
 
 		 316 aa  268  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  48.87 
 
 		 319 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  46.71 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  48.4 
 
 		 320 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  48.4 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  48.4 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  47.53 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  48.09 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  48.6 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  49.06 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  46.98 
 
 		 335 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  51.3 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  42.45 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  44.81 
 
 		 334 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  46.56 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  44.48 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  43.77 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  42.95 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  41.03 
 
 		 342 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  40.32 
 
 		 330 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  39.94 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  39.61 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  43.41 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  37.42 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  38.68 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  38.24 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  35.29 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  30.15 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  26.89 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.38 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  30.15 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.01 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  21.73 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  21.18 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  20.47 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  29.71 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.55 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.84 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.89 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  26.19 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  27.46 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.22 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.6 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  26.74 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.12 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  26.98 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  27.84 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  27.95 
 
 		 351 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  26.59 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2971  DNA polymerase III subunit delta  30.48 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  26.59 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  21.22 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  29.69 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  22.49 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  31.02 
 
 		 342 aa  46.2  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 		 344 aa  45.8  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  27.48 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  28.9 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  26.88 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25.37 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2832  DNA polymerase III subunit delta  30.77 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  28.78 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0366  DNA polymerase III delta  21.8 
 
 		 295 aa  43.1  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 336 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>