69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0686 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 320 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  79.3 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  53.58 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  57.19 
 
 		 319 aa  333  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  57.36 
 
 		 335 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  54.37 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  48.31 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  48.09 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  48.57 
 
 		 326 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  47.59 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  44.83 
 
 		 319 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  43.31 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  45.22 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  46.25 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  44.44 
 
 		 330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  44.73 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  44.03 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  44.55 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  44.55 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  44.55 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  44.3 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  43.31 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  41.16 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  43.3 
 
 		 319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  41.8 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  45.34 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  42.95 
 
 		 343 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  46.58 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  41.94 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  41.22 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  40.8 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  39.31 
 
 		 317 aa  185  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  39.12 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  42.48 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  37.9 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  37.74 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  33.65 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  29.41 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.79 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.03 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  28.31 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.49 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.96 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.47 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.08 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.71 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  22.6 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.07 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  29.7 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  22.85 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.03 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  24.05 
 
 		 378 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  20.89 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25.42 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.85 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  26.53 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  29.48 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  25.75 
 
 		 354 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  19.53 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  18.55 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  26.22 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.84 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  28.57 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  27.11 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  17.03 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  17.03 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>