74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0775 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 342 aa  655    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  46.42 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  45.17 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  50.9 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  46.63 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  44.03 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  41.05 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  44.87 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  40 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  41.03 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  41.85 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  43.11 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  42.07 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  39.68 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  38.86 
 
 		 330 aa  195  9e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  38.04 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  40.25 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  39.82 
 
 		 334 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  38.98 
 
 		 330 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  38.66 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  38.22 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  40.62 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  38.22 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  38.22 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  37.5 
 
 		 317 aa  186  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  41.59 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  39.24 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  38.1 
 
 		 317 aa  176  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  37.46 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  35.96 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  38.1 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  37.26 
 
 		 339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  41.8 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  36.77 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  41.61 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  30.91 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  36.39 
 
 		 328 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  27.41 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  30.43 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.88 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.55 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.33 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.07 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.52 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.5 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  24.45 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  23.51 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  22.39 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.29 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  26.15 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  22.86 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.22 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.15 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  25.52 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.85 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  17.85 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  17.85 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  30.99 
 
 		 312 aa  52.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  20.42 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25.91 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  18.32 
 
 		 335 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  23.51 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  15.95 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  20.92 
 
 		 325 aa  50.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  18.86 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  27.93 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  19.75 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.5 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  24.01 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  26.96 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>