60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2228 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 310 aa  584  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  64.92 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  62.21 
 
 		 334 aa  335  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  54.52 
 
 		 317 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  56.72 
 
 		 330 aa  328  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  54.37 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  59.68 
 
 		 339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  54.87 
 
 		 343 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  49.35 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  47.68 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  48.69 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  48.24 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  47.54 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  44.81 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  45.6 
 
 		 326 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  46.91 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  44.37 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  43.83 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  46.28 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  44.95 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  43.65 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  45.71 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  41.37 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  40.2 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  40.2 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  40.2 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  41.67 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  43.09 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  43.77 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  38.28 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  42.63 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  41.83 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  39.22 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  45.42 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  33.87 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  38.44 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  36.93 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  28.79 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.35 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.69 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  24.6 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.86 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.55 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.78 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  20.87 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.28 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  20.99 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  27.08 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  28.1 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.45 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.07 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.59 
 
 		 336 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  28.68 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.29 
 
 		 374 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  29.57 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  33.61 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.95 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>