66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1206 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  621  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  72.76 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  58.2 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  56.41 
 
 		 316 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  57.32 
 
 		 319 aa  305  9.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  54.75 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  51.14 
 
 		 330 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  52.2 
 
 		 326 aa  295  7e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  54.34 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  54.34 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  54.02 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  53.77 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  52.22 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  51.24 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  52.9 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  54.34 
 
 		 322 aa  268  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  47.95 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  47.95 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  48.89 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  46.25 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  49.21 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  47.68 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  42.16 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  44.13 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  49.84 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  41.1 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  45.4 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  41.85 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  41.46 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  39.1 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  39.48 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  42.26 
 
 		 343 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  42.45 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  44.3 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  40.27 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  36.05 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  31.97 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  29.25 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.73 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.11 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  28.4 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  31.69 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.54 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.71 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  21.65 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.86 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 334 aa  45.8  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  29.25 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  31.29 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.58 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.3 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.57 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  22.05 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  27.44 
 
 		 306 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>