73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7073 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 335 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  60.13 
 
 		 319 aa  348  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  59.75 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  52.31 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  57.36 
 
 		 320 aa  321  9.000000000000001e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  58.57 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  51.25 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  48.78 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  50.76 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  46.98 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  44.16 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  49.21 
 
 		 322 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  46.98 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  48.32 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  44.94 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  46.23 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  43.84 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  45.28 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  43.71 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  44.13 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  44.79 
 
 		 343 aa  222  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  44.13 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  43.67 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  43.81 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  43.81 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  43.81 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  45.39 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  48.33 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  49.52 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  42.54 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  38.39 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  42.36 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  41.18 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  44.55 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  41.05 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  42.46 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  32.19 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  28.27 
 
 		 348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.65 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.96 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.43 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.27 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.65 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  31.98 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.71 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  21.66 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.93 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  29.84 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  28.99 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.12 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  19.58 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  25.38 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.23 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.73 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  25.66 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  26.93 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.09 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  24.88 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  27.59 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  21.51 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  21.51 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  25.15 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>