68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3467 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 326 aa  638    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  92.94 
 
 		 326 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  56.6 
 
 		 319 aa  340  2e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  55.73 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  53.18 
 
 		 329 aa  315  9e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  52.22 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  52.2 
 
 		 322 aa  285  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  48.73 
 
 		 326 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  49.35 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  51.58 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  51.25 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  49.84 
 
 		 346 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  49.35 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  50.63 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  47.76 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  47.76 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  47.76 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  48.57 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  47.77 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  45.63 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  46.58 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  45.22 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  42.77 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  49.03 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  43.59 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  45.48 
 
 		 322 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  44.8 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  41.04 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  41.27 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  42.77 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  43.83 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  40 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  42.04 
 
 		 343 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  39.5 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  40.63 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  38.51 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  33.23 
 
 		 323 aa  132  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  30.32 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  27.3 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.63 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.22 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  25.31 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  24.61 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.65 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  26.97 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.25 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.07 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  29.02 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  21.54 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.05 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.62 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  21.22 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  28.53 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  28.21 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  28.21 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  27.02 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  20.86 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  27.08 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  28.48 
 
 		 345 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>