64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1739 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 334 aa  646    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  60.61 
 
 		 334 aa  348  9e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  57.19 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  55.52 
 
 		 317 aa  328  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  54.9 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  58.99 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  62.21 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  53.02 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  47.65 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  47.28 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  47.77 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  46.25 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  45.86 
 
 		 317 aa  246  6e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  46.58 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  46.37 
 
 		 326 aa  235  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  47.77 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  47.85 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  43.77 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  43.31 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  44.3 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  43.67 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  45.4 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  41.84 
 
 		 346 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  39.09 
 
 		 330 aa  192  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  36.74 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  43.11 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  39.56 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  40.84 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  39.56 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  42.4 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  39.24 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  39.87 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  34.88 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  39.24 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  43.14 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  36.77 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  36.83 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  37.82 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  22.7 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  28.73 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.26 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.26 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.26 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.26 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.9 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.51 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.26 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.42 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.39 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.34 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  21.52 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.75 
 
 		 329 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  23.47 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  29.15 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.49 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  22.32 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.94 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>