111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3591 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 328 aa  661    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.24 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.33 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.26 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.62 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.28 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  24.37 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  26.79 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25.76 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  28.85 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  26.8 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.82 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  31.98 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  22.3 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  24.83 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.19 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  28.17 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  22.78 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  26.04 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  25.75 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  27.31 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.11 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  26.43 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  26.29 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  23.58 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.26 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  26.99 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.28 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  24 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  20.69 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  26.98 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  26.98 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  27.74 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  27.74 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.2 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  25.33 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  24.1 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  28.83 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  21.85 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  26.25 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  22.19 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.53 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  23.22 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.53 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.53 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  26.37 
 
 		 458 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.15 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.53 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  24.66 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  22.1 
 
 		 323 aa  53.9  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  28.12 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  18.48 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  28 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.45 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  25.93 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  21.76 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  18.15 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  25.74 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0481  DNA polymerase III subunit delta  25.61 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  21.91 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  27.06 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  28.8 
 
 		 465 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.12 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  28.8 
 
 		 465 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  28.8 
 
 		 465 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  25.27 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  24.66 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  22.91 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  24.56 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  23.99 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  26.32 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  24.23 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  21.81 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  22.95 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  21.89 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  24.12 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  26.92 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  22.65 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  27.15 
 
 		 342 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  24.77 
 
 		 342 aa  45.8  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  23.58 
 
 		 343 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  23.92 
 
 		 342 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  25.35 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  27.16 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.86 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  27.16 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  24.17 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  21.07 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>