44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2643 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  99.14 
 
 		 465 aa  870    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  96.43 
 
 		 465 aa  762    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  100 
 
 		 465 aa  879    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  77.68 
 
 		 458 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  28.09 
 
 		 481 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  30.68 
 
 		 329 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  30.68 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  30.29 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  33.13 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.1 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.92 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  23.79 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  29.78 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  30.56 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  31.33 
 
 		 324 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.12 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  27.9 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  25.47 
 
 		 334 aa  53.5  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  36 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  29.21 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.89 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  28.8 
 
 		 328 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  29.75 
 
 		 323 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  29.08 
 
 		 374 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  20.71 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  20.71 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 		 330 aa  47.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  25.48 
 
 		 387 aa  47.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  34.69 
 
 		 315 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  28.5 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  21.76 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  18.04 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  25.41 
 
 		 331 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>