100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2048 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 334 aa  625  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  43.6 
 
 		 337 aa  222  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  36.76 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  35.8 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  37.39 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  31.76 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  32.55 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  31.47 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  37.35 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  37.28 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  35.62 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  35.29 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  34.97 
 
 		 343 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  29.43 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  36.09 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  31.4 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  31.94 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  31.04 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  39.83 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  29.11 
 
 		 346 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  30.24 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  32.15 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  29.91 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  28.21 
 
 		 346 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  28.49 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  20.54 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  32.44 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  21.99 
 
 		 334 aa  102  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  31.66 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  33.43 
 
 		 350 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  35.65 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  30.65 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  34.44 
 
 		 340 aa  86.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  20.76 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  29.18 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  29.57 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  28.65 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  30.11 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  27.05 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  26.61 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  26.51 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.18 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  34.44 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0795  DNA polymerase III, delta subunit  21.97 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.239391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.72 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  34.44 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  31.94 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  24.37 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0617  DNA polymerase III, delta subunit  28.21 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.733396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0457  DNA polymerase III, delta subunit  28.21 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3481  DNA-directed DNA polymerase  21.74 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000216936  unclonable  0.0000000000757173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.8 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2931  DNA polymerase III, delta subunit  21.93 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118412  decreased coverage  0.00725914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  32.88 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  32.19 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  32.19 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1185  DNA polymerase III subunit delta  27.27 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  21.88 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3146  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 		 341 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  28.8 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  33.1 
 
 		 342 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  34.25 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3145  DNA polymerase III, delta subunit  21.74 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000700325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004219  DNA polymerase III delta subunit  24.55 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00302346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0703  DNA polymerase III, delta subunit  21.3 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000446236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  30.14 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  32.88 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0703  DNA polymerase III subunit delta  25.43 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0770621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  27.37 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  30.14 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0762  DNA polymerase III subunit delta  25.43 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0689  DNA polymerase III subunit delta  25.43 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00596065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  33.56 
 
 		 345 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0749  DNA polymerase III subunit delta  25.43 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0941717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  24.12 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.13 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01220  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  33.15 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3017  DNA polymerase III subunit delta  23.62 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1844  DNA polymerase III subunit delta  23.62 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2928  DNA polymerase III subunit delta  23.62 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0806  DNA polymerase III subunit delta  25.43 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  27.38 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  27.97 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0692  DNA polymerase III subunit delta  24.65 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000216936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00609  DNA polymerase III subunit delta  24.65 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0200544  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  30.22 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00598  hypothetical protein  24.65 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0206116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1174  DNA polymerase III subunit delta  24.6 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.874565  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0666  DNA polymerase III subunit delta  24.65 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000205044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  29.63 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0729  DNA polymerase III subunit delta  24.65 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000331026  normal  0.281474 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3005  DNA polymerase III subunit delta  24.65 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00124747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  25.64 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3271  DNA polymerase III, delta subunit  20.86 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00947649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3313  DNA polymerase III, delta subunit  20.86 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000619829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1096  DNA polymerase III, delta subunit  20.86 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00712318  hitchhiker  0.000000000697762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3449  DNA polymerase III, delta subunit  20.86 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0222652  hitchhiker  0.000721711 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0660  DNA polymerase III subunit delta  28.67 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000888397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>