135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1587 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 333 aa  672    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  41.12 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  34.45 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  31.19 
 
 		 344 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  33.79 
 
 		 348 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  31.33 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  30.42 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  30.72 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  30.42 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  30.42 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  30.42 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  30.42 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  30.42 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  29.28 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  27.41 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  29 
 
 		 334 aa  113  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  29.05 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  29.05 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.99 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  26.27 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  26.97 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  30.38 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  24.62 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.97 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  28.57 
 
 		 337 aa  95.9  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 329 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  26.23 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  32.38 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  28.52 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  24.76 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  25.39 
 
 		 324 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.55 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  27 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  25.95 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  22.58 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  25.77 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.86 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  24.25 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  26.52 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.03 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.61 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.85 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  23.67 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.37 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  25.86 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.59 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  27.14 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  25.33 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.88 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  27.88 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  30.65 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  23.14 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  25.77 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  25.24 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  21.56 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  24.29 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  24.53 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  22.99 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  24.71 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  22.63 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  22.57 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  21.15 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  26.26 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  23.85 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  23.74 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  22.6 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  21.66 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  27.78 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  22.29 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  23.02 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  23.01 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  21.23 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  22.54 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  23.68 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  23.55 
 
 		 342 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  25.7 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  23.31 
 
 		 342 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  22.47 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  27.39 
 
 		 319 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  22.01 
 
 		 316 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  22.12 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  24.65 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  21.99 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  22.59 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  28.06 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  25.12 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>