66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0083 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
319 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  35.47 
 
 
328 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  35.6 
 
 
324 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  33.23 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  33.23 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  32.52 
 
 
329 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  34.5 
 
 
316 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  30.96 
 
 
336 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  34.19 
 
 
319 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  34.06 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  30.99 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  32.06 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  30.31 
 
 
318 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 
342 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  28.26 
 
 
342 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  29.1 
 
 
332 aa  138  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  28.35 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  27.73 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  27.1 
 
 
333 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  28.26 
 
 
335 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  26.17 
 
 
333 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  27.03 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  26.8 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  22.12 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  23.22 
 
 
350 aa  62.4  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  20.55 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  24.03 
 
 
323 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.32 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.81 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.73 
 
 
339 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  25.4 
 
 
324 aa  55.8  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  21.83 
 
 
348 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  25.7 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  23.9 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  21.36 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  21.81 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 
387 aa  53.1  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  24.07 
 
 
338 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.3 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.3 
 
 
336 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  23.2 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.3 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.3 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.87 
 
 
336 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.98 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.98 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.98 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.98 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.98 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  24.04 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  21.69 
 
 
335 aa  49.3  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.27 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  22.82 
 
 
342 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.01 
 
 
346 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  19.7 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  22.01 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  22.8 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  21.2 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  21.43 
 
 
348 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  20.49 
 
 
342 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>