67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0072 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 
321 aa  631  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  87.85 
 
 
321 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  72.07 
 
 
336 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  56.33 
 
 
335 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  48.95 
 
 
342 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  49.55 
 
 
342 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  34.44 
 
 
333 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  32.63 
 
 
333 aa  225  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  33.23 
 
 
333 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  32.63 
 
 
333 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  37.26 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  36.86 
 
 
329 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  36.11 
 
 
327 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  36.11 
 
 
327 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  36.42 
 
 
324 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  36.39 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  35.28 
 
 
316 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  34.26 
 
 
328 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  32.15 
 
 
318 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  31.36 
 
 
319 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  28.53 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.86 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.06 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.55 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.78 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  27.19 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.83 
 
 
336 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.39 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  28.91 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  25.59 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  22.92 
 
 
339 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.83 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  25.28 
 
 
344 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  22.83 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 
335 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.31 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  29.06 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  26.87 
 
 
312 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  26.63 
 
 
350 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  27.1 
 
 
330 aa  49.3  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  21.18 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  29.39 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  22.18 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.33 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  21.99 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  29.32 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  23.25 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  22.43 
 
 
374 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  29.1 
 
 
342 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0670  DNA polymerase III delta  21.43 
 
 
320 aa  42.7  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.840892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>