96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3459 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 324 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  64.11 
 
 		 327 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  64.11 
 
 		 327 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  53.66 
 
 		 328 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  54.15 
 
 		 328 aa  352  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  52.92 
 
 		 329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  53.85 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  51.39 
 
 		 332 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  36.42 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  33.53 
 
 		 342 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  36.42 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  33.53 
 
 		 342 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  36.27 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  36.74 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  33.75 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  35.6 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  29.73 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  29.73 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  29.76 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  29.52 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  32.04 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.33 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  25.97 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  24.64 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  29.02 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.48 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.5 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.94 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.55 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  27.35 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.94 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.11 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25.91 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  28.52 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  26.29 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  26.39 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  26.1 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.04 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24.04 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24.04 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.04 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  29.41 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24.04 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  24.04 
 
 		 336 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  24.04 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  24.04 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  26.81 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  25.39 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.4 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  27.14 
 
 		 323 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  24.46 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.08 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  28.1 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.54 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.13 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.12 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  28.06 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  25.58 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  22.94 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  23.74 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  23.02 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  24.69 
 
 		 342 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  24.28 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  22.27 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0767  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0743  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.99 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  25.12 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  24.14 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  24.76 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.72 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  25.53 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  26.11 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  25.35 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  30.3 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  25.09 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  25.93 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  29.12 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  24.58 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1151  DNA polymerase III, delta  23.68 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.4 
 
 		 582 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  28.68 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  22.05 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  24.86 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  27.87 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  23.46 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.12 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  23.46 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  21.73 
 
 		 317 aa  42.4  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>