63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0811 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 387 aa  794    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  29 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  26.94 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.53 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.36 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.19 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  24.79 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  24.79 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  24.59 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  24.59 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.5 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  23.95 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  24.79 
 
 		 336 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.16 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  25.2 
 
 		 465 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  24.09 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  26.51 
 
 		 331 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  23.44 
 
 		 319 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  22.62 
 
 		 332 aa  53.1  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  25.2 
 
 		 465 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  24.41 
 
 		 465 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  23.65 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.36 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  23.28 
 
 		 458 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  23.74 
 
 		 324 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  20.44 
 
 		 344 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  25.5 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  22.26 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  22.56 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  23.57 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  24.77 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.56 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  24.77 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  22.22 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 		 335 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  22.75 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  20.44 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  31.78 
 
 		 346 aa  46.2  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  22.82 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  24.58 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  24.16 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  22.35 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  22.75 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  34.62 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  25.49 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  26.19 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  35.24 
 
 		 342 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  24.17 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  26.18 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  30.83 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  24.15 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  38.57 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  34.94 
 
 		 357 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  22.03 
 
 		 328 aa  43.1  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  24.35 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>