92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0405 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 332 aa  670    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  55.96 
 
 		 329 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  55.86 
 
 		 328 aa  358  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  51.85 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  51.85 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  51.39 
 
 		 324 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  53.07 
 
 		 328 aa  331  9e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  51.74 
 
 		 316 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  37.65 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  36.39 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  36.51 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  34.67 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  28.44 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  33.12 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  28.74 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  29.43 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  29.13 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  28.01 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  27.03 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  33.23 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  29.1 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  27.47 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.63 
 
 		 337 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.69 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  26.85 
 
 		 331 aa  93.2  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  27.38 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  27.33 
 
 		 337 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.64 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.64 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.84 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.64 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  27.16 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.55 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.16 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  25.31 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.48 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  24.89 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.04 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.09 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  26.79 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  27.57 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  25.79 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.98 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  22.08 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  27.91 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  34.09 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  25.55 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.4 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  26.04 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  21.56 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  24.28 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  25.97 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.4 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.42 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  25.13 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  25.13 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  28.33 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25.72 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  21.12 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  22.58 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.01 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  29.46 
 
 		 331 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  23.55 
 
 		 341 aa  49.3  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0767  DNA polymerase III, delta subunit  21.95 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.31 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  27.05 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0743  DNA polymerase III, delta subunit  21.95 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  24.18 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  24.16 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  31.25 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  25.97 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.32 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  22.74 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  21.17 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  22.22 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  26.11 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  24.36 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  32.12 
 
 		 351 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  23.01 
 
 		 399 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>