48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18371 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 333 aa  660    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  96.4 
 
 		 333 aa  643    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  92.47 
 
 		 333 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  69.97 
 
 		 333 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  35.03 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  33.23 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  37.24 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  33.84 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  37.5 
 
 		 342 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  37.24 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  33.04 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  33.04 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  30.93 
 
 		 329 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  29.73 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  29.43 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  27.93 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  30.33 
 
 		 328 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  32.43 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  27.73 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  28.23 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  24.68 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  22.22 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  22.61 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.15 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  21.92 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  25.94 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.4 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  21.64 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  26.44 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  20.68 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  20.68 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  20.43 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  20.37 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.15 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  20.43 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  20.06 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.69 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  20.68 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  20.68 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  20.68 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  20.68 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  20.68 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  19.44 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.17 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  31.07 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  26.24 
 
 		 387 aa  42.4  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>