47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18561 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  96.4 
 
 		 333 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 333 aa  659    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  92.47 
 
 		 333 aa  617  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  70.57 
 
 		 333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  34.73 
 
 		 336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  32.63 
 
 		 321 aa  222  8e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  36.64 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  32.33 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  36.9 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  36.64 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  32.44 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  32.44 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  29.76 
 
 		 324 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  30.33 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  29.13 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  27.33 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  29.73 
 
 		 328 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  31.08 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  28.35 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  27.63 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  24.84 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.27 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.32 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.84 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.21 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  20.91 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  20.56 
 
 		 336 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  20.56 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  20.25 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  21.64 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  24.81 
 
 		 338 aa  49.7  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  20 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  20 
 
 		 336 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.95 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  20.25 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.18 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  20.25 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  20.25 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  20.25 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  20.25 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  19.69 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  18.81 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  19.7 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>