53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5666 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 319 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  38.89 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  33.79 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  34.77 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  33.96 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  33.23 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  34.69 
 
 		 328 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  30.23 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  30.23 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  30.18 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  32.04 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  28.53 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  30.58 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  30.13 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21151  DNA polymerase III subunit delta  28.31 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1245  DNA polymerase III subunit delta  27.69 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17731  DNA polymerase III subunit delta  30.49 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18561  DNA polymerase III subunit delta  24.84 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.318986  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18371  DNA polymerase III subunit delta  24.53 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.926744  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  24.84 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18371  DNA polymerase III subunit delta  24.92 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.68 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25.32 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.74 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  27.46 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2387  DNA polymerase III subunit delta  29.35 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.778182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  28 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25.37 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.81 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  23.87 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  21.19 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  23.74 
 
 		 334 aa  45.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  23.08 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  27.06 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  24.44 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  24.7 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  24.46 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  27.78 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>