86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0949 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  693    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  36.84 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  38.08 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  37.95 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  35.88 
 
 		 344 aa  212  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  37.92 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  35.93 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  31.55 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  30.93 
 
 		 331 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  31.64 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  27.42 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  29.71 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  23.36 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.47 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.47 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.47 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.47 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  24.53 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.82 
 
 		 344 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.84 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  25.16 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  25.77 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  24.3 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  25 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  23.29 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  23.44 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  25.47 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  24.24 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.01 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  24.41 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  23.55 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  24.19 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.15 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  22.15 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.11 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  24.48 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  27.51 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  22.08 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  26.39 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  22.51 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  23.64 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  23.64 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  27.11 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  20.55 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  21.55 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  25.36 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  20.59 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  20 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  27.49 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  25.09 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0083  DNA polymerase III subunit delta  23.2 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  24.1 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  23.91 
 
 		 327 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  29.44 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  24.27 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  22.27 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  22.27 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  24.18 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25.93 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  20.66 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  25.83 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.01 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  23.25 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  23.25 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  22.44 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  26.46 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  21 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  20.08 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  19.3 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  20.75 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2026  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  20.97 
 
 		 681 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  23.21 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  21.21 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  20.89 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  23.61 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  20.09 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0476  DNA polymerase III subunit delta  22.86 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.159232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>