157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3192 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 354 aa  704    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  82.22 
 
 		 315 aa  522  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  56.83 
 
 		 324 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  45.28 
 
 		 323 aa  258  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  33.67 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  32.69 
 
 		 330 aa  143  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  32.89 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  29.87 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  32.62 
 
 		 337 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  26.98 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  28.17 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  28.8 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  30.19 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  27.25 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  26.89 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  27.74 
 
 		 346 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  25.79 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  28.95 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  28.07 
 
 		 419 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  27.6 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  27.19 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.68 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  32.26 
 
 		 336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  27.27 
 
 		 336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  22.98 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  27.27 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  27.27 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  27.27 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  28.83 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  27.27 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  26.52 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  28.01 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 336 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  33.58 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  30.42 
 
 		 332 aa  106  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  28.98 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  30.58 
 
 		 306 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  26.46 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  28.03 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  22.84 
 
 		 338 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  24.44 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 335 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  24.68 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  24.83 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  24.5 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.45 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  23.27 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  26.46 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  29.92 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  21.25 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  26.15 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.84 
 
 		 334 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  24.84 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  27.14 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  23.3 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  25.59 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  23.38 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.82 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  27.55 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  21.9 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  22.47 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  28.89 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  30.56 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  24.29 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  24.14 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  21.23 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  28.09 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  25.53 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  22.05 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  25.66 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  23.53 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  25.65 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  20.41 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  23.13 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0699  DNA polymerase III delta  24.36 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000587672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  23.23 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  26.16 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3704  DNA polymerase III, delta subunit  23.79 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000203003  decreased coverage  0.000000325428 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  24.23 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1936  recombination factor protein RarA  28.82 
 
 		 453 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.980875  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01043  recombination factor protein RarA  30.24 
 
 		 458 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06123  recombination factor protein RarA  30.24 
 
 		 458 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0463841  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  22.09 
 
 		 354 aa  52.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  24.1 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  28.19 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  21.6 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  26.48 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  29.21 
 
 		 465 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  28.14 
 
 		 481 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  27.4 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>