136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3265 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 378 aa  767    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  38.01 
 
 		 346 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  34.69 
 
 		 335 aa  216  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  31.18 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  31.84 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  32.26 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  28.34 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  31.75 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  28.07 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  29.12 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  27.67 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  27.55 
 
 		 338 aa  149  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  29.28 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  27.42 
 
 		 344 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.57 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  28.97 
 
 		 329 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.01 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  28.73 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  28.73 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  28.97 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  28.73 
 
 		 336 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  28.73 
 
 		 336 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  28.45 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.45 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  28.45 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  27.91 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  27.98 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  28.45 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  29.15 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  28.45 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  27.4 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.97 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.27 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  30.93 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  27.3 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  25.63 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  24.43 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  22.97 
 
 		 350 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  26.56 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  23.88 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  24.09 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  24.62 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  24.62 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  29.77 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.93 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.81 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  23.81 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  23.43 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  21.8 
 
 		 339 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  26.38 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  24.59 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  23.94 
 
 		 335 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  23.89 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  23.85 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  23.54 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  21.25 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  23.85 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.19 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.93 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  24.53 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  26.67 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  22.4 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  24.61 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  24.32 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  21.35 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  20.6 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.51 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  24.89 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  22.03 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  23.76 
 
 		 331 aa  72.8  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  23.39 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  25.37 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  23.32 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  31.98 
 
 		 328 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.92 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  23.74 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  20.63 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  32.79 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  24.33 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  24.72 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  23.17 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  23.28 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  21.92 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  21.68 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  27.54 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  23.24 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  23.43 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  22.61 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  23.39 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  23.65 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  23.39 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  23.85 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  22.09 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  24.58 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  22.37 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  23.82 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.33 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  20.47 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>