77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1613 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 330 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  52.27 
 
 		 329 aa  301  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  52.32 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  51.14 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  49.35 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  48.08 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  46.35 
 
 		 319 aa  259  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  45.13 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  45.45 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  45.45 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  44.23 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  44.19 
 
 		 319 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  44.13 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  44.97 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  42.15 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  45.98 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  43.84 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  41.96 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  42.7 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  46.46 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  42.68 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  38.7 
 
 		 324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  38.1 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  39.09 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  39.3 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  45.02 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  38.98 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  36.63 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  33.89 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  34.98 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  37.81 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  35.26 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  37.62 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  33.02 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  34.81 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  35.24 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  29.45 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  27.36 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.77 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.1 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.89 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  24.57 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  27.85 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.52 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  28.64 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  24.83 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.89 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  25.81 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  29.53 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  26.97 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  25.57 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  20.97 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  22.68 
 
 		 334 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  20.92 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  20.92 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  20.92 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  20.92 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  20.92 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.42 
 
 		 348 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.16 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25.52 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.16 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  20.74 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.16 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  26.51 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.16 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  20 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  25.68 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  19.49 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  24.75 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  26.82 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  21.56 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  18.44 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  22.9 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  28.36 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  26.4 
 
 		 344 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>