96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1144 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1144  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 325 aa  636    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2278  DNA polymerase III delta subunit-like protein  71.56 
 
 		 327 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00793945  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  62.97 
 
 		 319 aa  373  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  53.58 
 
 		 320 aa  318  7e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0823  DNA polymerase III, delta subunit  56.83 
 
 		 346 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00704203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7073  DNA polymerase III, delta subunit  52.31 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  52.22 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  50 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  49.53 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3846  DNA polymerase III, delta subunit  50.79 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1560  DNA polymerase III, delta subunit  47.19 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  46.89 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13290  DNA polymerase III, delta subunit  46.75 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1739  DNA polymerase III, delta subunit  47.65 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2243  DNA polymerase III, delta subunit  44.44 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0775  DNA polymerase III, delta subunit  45.17 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.168506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1206  hypothetical protein  47.95 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  42.86 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1980  DNA polymerase III, delta subunit  41.07 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3422  DNA polymerase III, delta subunit  44.41 
 
 		 343 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3913  hypothetical protein  43.51 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1613  DNA polymerase III, delta subunit  42.15 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3523  hypothetical protein  44.05 
 
 		 320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.360312  normal  0.150751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3511  hypothetical protein  44.05 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3583  hypothetical protein  44.05 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  0.0173863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1259  DNA polymerase III, delta subunit  45.73 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.098932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2664  hypothetical protein  42.09 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2208  DNA polymerase III, delta subunit  44.16 
 
 		 339 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2104  DNA polymerase III, delta subunit  47.74 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2801  DNA polymerase III delta  40.14 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.050478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17390  DNA polymerase III, delta subunit  38.73 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0161852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17400  DNA polymerase III, delta subunit  41.72 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.919832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3186  DNA polymerase III delta  40.45 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0332  DNA polymerase III subunit delta  37.07 
 
 		 323 aa  196  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12441  hypothetical protein  40.19 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2228  DNA polymerase III, delta subunit  45.21 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12440  DNA polymerase III, delta subunit  38.66 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.203264  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0941  putative DNA polymerase III, delta subunit  34.22 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  24.29 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.98 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  26.65 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  27.27 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.14 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.69 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  25.79 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  24.17 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  26.78 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  31.84 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.55 
 
 		 332 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  25.74 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  26.25 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.51 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  22.57 
 
 		 330 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  24.92 
 
 		 345 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  22.47 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.12 
 
 		 334 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  29.91 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  20.87 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.34 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2130  DNA polymerase III, delta subunit  30.5 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0903224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.32 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  27.94 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  22.74 
 
 		 343 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  21.99 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  22.36 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  27.31 
 
 		 351 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  19.31 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  28 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  23.66 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  22.38 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  23.2 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  26.91 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  19.73 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  26.91 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0617  DNA polymerase III, delta subunit  25.77 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.733396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0457  DNA polymerase III, delta subunit  25.77 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  28.46 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  26.91 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  19.63 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  25.4 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  27.38 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1832  DNA polymerase III, delta subunit  22.57 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.278991  unclonable  0.000000000740482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  23.19 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  22.1 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>