120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1832 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1832  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 355 aa  726    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.278991  unclonable  0.000000000740482 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0574  DNA polymerase III, delta subunit  66.01 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000281355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0564  DNA polymerase III, delta subunit  66.01 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0256  DNA polymerase III, delta subunit  25.3 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  26.24 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2742  DNA polymerase III subunit delta  25.85 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4600  DNA polymerase III subunit delta  28.17 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0234  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2571  DNA polymerase III subunit delta  26.35 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225423  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2981  DNA polymerase III subunit delta  26.06 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2971  DNA polymerase III subunit delta  27.88 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0760  DNA polymerase III subunit delta  26.57 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1213  DNA polymerase III subunit delta  25.38 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 348 aa  99.8  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3769  DNA polymerase III subunit delta  27.16 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2451  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3449  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.785603  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0368  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1227  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.859093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3413  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3448  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2638  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0173  DNA polymerase III subunit delta  24.79 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0656  DNA polymerase III subunit delta  24.79 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121282  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  28.04 
 
 		 334 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3742  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0768215 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  27.75 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2586  DNA polymerase III subunit delta  25.3 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000748546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0551  DNA polymerase III subunit delta  25.76 
 
 		 364 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0556298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0577  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0424  DNA polymerase III subunit delta  26.63 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.813345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0481  DNA polymerase III, delta subunit  29.38 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0513  DNA polymerase III, delta subunit  24.12 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0623  DNA polymerase III subunit delta  24.79 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2832  DNA polymerase III subunit delta  25.08 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  25.07 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3915  DNA polymerase III subunit delta  27.3 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  24.56 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3264  DNA polymerase III subunit delta  26.8 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0481  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2730  DNA polymerase III subunit delta  24.39 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.969457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4546  DNA polymerase III subunit delta  28.16 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0964  DNA polymerase III subunit delta  28.83 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2931  DNA polymerase III, delta subunit  28.83 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118412  decreased coverage  0.00725914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  23.93 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2917  DNA polymerase III, delta subunit  23.82 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0216  DNA polymerase III subunit delta  26.36 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.533896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0578  DNA polymerase III subunit delta  24.62 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6001  DNA polymerase III subunit delta  27.87 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1060  DNA polymerase III, delta subunit  26.99 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0315108  hitchhiker  0.00717458 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0999  DNA polymerase III, delta subunit  26.99 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.119076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  26.07 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0542  DNA polymerase III subunit delta  23.76 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0995  DNA polymerase III, delta subunit  26.99 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0109002  normal  0.117484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.89 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3378  DNA polymerase III subunit delta  24.92 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.930897  hitchhiker  0.00000000672182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3481  DNA-directed DNA polymerase  24.92 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000216936  unclonable  0.0000000000757173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  24.36 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  28.01 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1508  DNA polymerase III, delta subunit  25.66 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0182978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  24.78 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  25.07 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  25.73 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0671  DNA polymerase III, delta subunit  25.36 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00374825  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1200  DNA polymerase III subunit delta  26.3 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.972787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1172  DNA polymerase III, delta subunit  25.77 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  25.36 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  24.42 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  26.43 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  24.36 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  25.14 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3704  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000203003  decreased coverage  0.000000325428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  21.76 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3271  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00947649  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0988  DNA polymerase III subunit delta  25.34 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3313  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000619829  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1096  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 343 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00712318  hitchhiker  0.000000000697762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2130  DNA polymerase III, delta subunit  22.51 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0903224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01661  putative DNA polymerase III, delta subunit, probably ATP hydrolase  21.98 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000516884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  26.38 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3145  DNA polymerase III, delta subunit  25.83 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3449  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0222652  hitchhiker  0.000721711 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1378  DNA polymerase III subunit delta  22.71 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.212433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1311  DNA polymerase III subunit delta  22.71 
 
 		 343 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1742  DNA polymerase III, delta subunit  23.24 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.260854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  23.7 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0476  DNA polymerase III subunit delta  23.98 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.159232  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0457  DNA polymerase III, delta subunit  21.22 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0703  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000446236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0617  DNA polymerase III, delta subunit  21.22 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.733396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2584  DNA-directed DNA polymerase  26.61 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000509755  normal  0.168307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004219  DNA polymerase III delta subunit  21.07 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00302346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1189  DNA polymerase III, delta subunit  22.02 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.725755  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2865  DNA polymerase III, delta subunit  23.01 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00085099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1185  DNA polymerase III subunit delta  23.48 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2960  DNA polymerase III subunit delta  21.84 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3146  DNA polymerase III subunit delta  23.47 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>