40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl368 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  631  1e-180  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  43.04 
 
 
316 aa  241  1e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.51 
 
 
344 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  23.38 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  22.44 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  24.06 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.64 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.64 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.64 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.64 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.64 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  23.82 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  23.53 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.96 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.18 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  22.86 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  22.86 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.01 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  26.17 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf317  DNA polymerase III, delta subunit  22.46 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  20.39 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  22.38 
 
 
334 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  23.74 
 
 
333 aa  59.3  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  20.88 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  22.79 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  20.56 
 
 
331 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  24.46 
 
 
324 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  18.77 
 
 
343 aa  52.8  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  20.16 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  19.79 
 
 
325 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  21.4 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  23.57 
 
 
334 aa  49.3  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  21.69 
 
 
332 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  19.38 
 
 
332 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  21.31 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  22.11 
 
 
378 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  16.97 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.26 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>