41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0743 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0767  DNA polymerase III, delta subunit  99.69 
 
 		 324 aa  648    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0743  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 324 aa  649    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1151  DNA polymerase III, delta  36.79 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0670  DNA polymerase III delta  34.81 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.840892  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0868  DNA polymerase III delta  29.64 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  26.8 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  22.71 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  30.95 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  30.95 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  30.95 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  33.61 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  34.52 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  22.15 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  33.33 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1508  DNA polymerase III, delta subunit  28.78 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0182978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.47 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0671  DNA polymerase III, delta subunit  28.78 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00374825  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  31.03 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  24.52 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  21.34 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  20.85 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  23.27 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  33.33 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  26.96 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  27.54 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  32.08 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  25.93 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  30.3 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  24.36 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  25.35 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2130  DNA polymerase III, delta subunit  23.83 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0903224 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  24.69 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  30.7 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  35.9 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  27.54 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  38.96 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  19.85 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>