75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4096 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 345 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  68.6 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  68.02 
 
 		 343 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  68.31 
 
 		 343 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  67.06 
 
 		 342 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  67.64 
 
 		 342 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  45.09 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  45.24 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  45.58 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  44.22 
 
 		 342 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  41.33 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  41.45 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  41.91 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  42.94 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  42.57 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  41.64 
 
 		 340 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  37.71 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  35.38 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  36.11 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  35.19 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  36.18 
 
 		 347 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  35.8 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  35.34 
 
 		 343 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  36.08 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  37.42 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  35.96 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  36.72 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  37.45 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  35.08 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  39.83 
 
 		 334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  28.66 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  29.38 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  31.25 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  20.51 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  29.61 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  30.58 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  21.5 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  29.61 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  29.67 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  29.19 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  27.49 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  25.78 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  27.61 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  26.05 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2910  DNA polymerase III subunit delta  28.63 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  27.35 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  27.35 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  27.35 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01876  DNA polymerase III subunit delta  28.75 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.84431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  28.16 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  25.62 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  24.77 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.71 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  28.72 
 
 		 345 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2931  DNA polymerase III, delta subunit  20.98 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118412  decreased coverage  0.00725914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.93 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  28.72 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  20.14 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  27.8 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  26.53 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  23.93 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3310  DNA polymerase III subunit delta  29.19 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0143934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  24.88 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  26.12 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  27.36 
 
 		 342 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2443  DNA polymerase III, delta subunit  28.63 
 
 		 344 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  26.11 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01661  putative DNA polymerase III, delta subunit, probably ATP hydrolase  20.73 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000516884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  21.54 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  26.04 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  25.89 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  26.01 
 
 		 327 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.7 
 
 		 325 aa  43.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>