39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0409 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 343 aa  680    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  59.05 
 
 		 341 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  57.99 
 
 		 342 aa  384  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  56.43 
 
 		 342 aa  358  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  51.04 
 
 		 330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  50.74 
 
 		 330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  52.52 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  32.94 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  29.53 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  31.23 
 
 		 350 aa  96.3  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  28.08 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  28.44 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  28.44 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  28.14 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  27.46 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  28.23 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  29.97 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  29 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  26.69 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  26.65 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  29.26 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  30.84 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  27.68 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  28.43 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  26.12 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  26.02 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  26.44 
 
 		 343 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  26.42 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  25.9 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  25.08 
 
 		 388 aa  53.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  24.84 
 
 		 347 aa  53.1  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  24.18 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  25.19 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  27.45 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  27.63 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  26.02 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  22.69 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  31.15 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  26.53 
 
 		 346 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>