47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2959 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 350 aa  686    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  37.85 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  39.49 
 
 		 347 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  34.33 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  34.53 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  33.7 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  36 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  31.75 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  32.87 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  38.3 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  40.27 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  33.79 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  33.33 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  32.56 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  37.02 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  37.45 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  36.6 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  36.6 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  29.68 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  29.68 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  29.74 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  29.35 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  31.55 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  31.03 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  33.05 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  32.34 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  29.91 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  28.43 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  30.26 
 
 		 347 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  33.08 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  30.37 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  31.3 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  29.63 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  29.1 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  30.66 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  28.7 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  29.6 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  29.6 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  29.29 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  27.7 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  27.12 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  20.9 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  19.07 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  22.73 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.56 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>