43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2850 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 340 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  41.69 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  33.23 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  30.17 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  31.41 
 
 		 342 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  29.1 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  28.9 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  33.62 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  31.25 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  33.05 
 
 		 343 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  32.2 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  33.55 
 
 		 342 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  27.94 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  27.94 
 
 		 347 aa  85.9  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  23.99 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  27.1 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  29.18 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  27.5 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  29.01 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  30.77 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  31.9 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  32.89 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  28.32 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  29.97 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  26.35 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  31 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  26.84 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  31.32 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  31.17 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  28.57 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  29.75 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  29.57 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  25.74 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  30.52 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  29.82 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  27.35 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2496  DNA polymerase III, delta  29.39 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  20.3 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  32.03 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  18.38 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3137  DNA polymerase III, delta  26.04 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.226338  hitchhiker  0.0000037205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  33.03 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  27.83 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>