32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf317 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf317  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 
322 aa  635    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  22.46 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  26.43 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  22.52 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  21.81 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  22.52 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  20.54 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  22.52 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  22.82 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  22.52 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  22.52 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  22.52 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  22.58 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  26.11 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  20.12 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  25.84 
 
 
331 aa  52.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  23.31 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  22.65 
 
 
331 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  21.74 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  20.44 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  22.66 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.92 
 
 
337 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  23.47 
 
 
344 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  21.08 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  22.64 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  17.46 
 
 
334 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  22.63 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  18.41 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  22.26 
 
 
348 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>