More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0759 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 406 aa  811    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 414 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.89 
 
 		 396 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.386674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01024  chemotaxis protein  35.09 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0730182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06142  chemotaxis protein  35.09 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0352354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0260  putative chemotaxis transducer  31.9 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0724  chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02270  putative chemotaxis transducer  32.29 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0155  methyl-accepting chemotaxis protein  30.31 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3111  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.62 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.76 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3125  chemotaxis sensory transducer  26.87 
 
 		 407 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.443773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00410  methyl-accepting chemotaxis protein  27.51 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.894674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2117  methyl-accepting chemotaxis protein  32.45 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.08 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0668336  normal  0.991447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.08 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.08 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0952292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.410986  normal  0.95878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03238  chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0552  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.53 
 
 		 648 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283806  decreased coverage  0.00439756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0515  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 656 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 661 aa  94.4  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 655 aa  94.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 661 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.18 
 
 		 656 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0916  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  30.36 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1571  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.92 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.38 
 
 		 563 aa  93.6  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  33.87 
 
 		 712 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4758  chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 		 685 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0781085  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 640 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.04 
 
 		 716 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 548 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  31.94 
 
 		 712 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  34.43 
 
 		 540 aa  91.3  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 630 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 630 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.75 
 
 		 643 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 		 540 aa  90.5  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.75 
 
 		 628 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.75 
 
 		 628 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  33.2 
 
 		 566 aa  90.5  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 		 772 aa  90.5  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  29.49 
 
 		 561 aa  90.5  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2179  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.76 
 
 		 630 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.04 
 
 		 604 aa  89.7  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.41 
 
 		 620 aa  90.1  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1713  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 666 aa  89.7  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000425798  normal  0.0665929 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  42.18 
 
 		 633 aa  89.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 527 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  42.07 
 
 		 630 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 630 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0789  chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1012  hypothetical protein  37.71 
 
 		 626 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 645 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  35.22 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.04 
 
 		 552 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 630 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 630 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 		 630 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 636 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 		 630 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  40.12 
 
 		 656 aa  89.4  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 		 566 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.03 
 
 		 630 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3929  methyl-accepting chemotaxis protein  29.67 
 
 		 505 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 		 620 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 534 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.555356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 		 629 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  30.74 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1854  chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 		 536 aa  88.6  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001368  methyl-accepting chemotaxis protein  37.71 
 
 		 519 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 560 aa  88.2  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.14 
 
 		 527 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  35.91 
 
 		 666 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 634 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1223  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  31.02 
 
 		 663 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 		 643 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  37.5 
 
 		 634 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0913  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 		 685 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.73 
 
 		 630 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0372  methyl-accepting chemotaxis protein  42.42 
 
 		 465 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.47 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 566 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  41.38 
 
 		 568 aa  87.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 620 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 654 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.58 
 
 		 626 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.18 
 
 		 638 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.39 
 
 		 688 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.16 
 
 		 523 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1554  methyl-accepting chemotaxis protein  37.84 
 
 		 684 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>