More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3125 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3125  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 407 aa  825    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.443773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0724  chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0260  putative chemotaxis transducer  29.14 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02270  putative chemotaxis transducer  30.48 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.87 
 
 		 406 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.38 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.386674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01024  chemotaxis protein  30.9 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0730182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06142  chemotaxis protein  30.9 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0352354  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0155  methyl-accepting chemotaxis protein  25.69 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3111  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.31 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04747  methyl-accepting chemotaxis protein  31.78 
 
 		 361 aa  99.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2117  methyl-accepting chemotaxis protein  26.94 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.36 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.894674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.05 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0668336  normal  0.991447 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22670  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.17 
 
 		 737 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.87 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00569391  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00866  hypothetical protein  42.68 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.82 
 
 		 540 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.22 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.8 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0952292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 		 638 aa  94.4  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.8 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 		 539 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.417897  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 		 378 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.410986  normal  0.95878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 		 539 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0971462  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  35.2 
 
 		 481 aa  93.6  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3929  methyl-accepting chemotaxis protein  38.37 
 
 		 505 aa  93.2  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.62 
 
 		 539 aa  92.8  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0243326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2682  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 723 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  31.38 
 
 		 541 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  35.98 
 
 		 653 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  33.59 
 
 		 545 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  31.44 
 
 		 480 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  56.47 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 685 aa  90.5  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4711  methyl-accepting chemotaxis protein  31.91 
 
 		 633 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00410  methyl-accepting chemotaxis protein  33.14 
 
 		 394 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1554  methyl-accepting chemotaxis protein  36.32 
 
 		 684 aa  90.9  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 		 554 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 482 aa  90.9  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  37.79 
 
 		 731 aa  90.9  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 		 554 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0602  methyl-accepting chemotaxis protein  33.51 
 
 		 536 aa  90.5  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.99 
 
 		 646 aa  90.1  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 		 543 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 		 543 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 		 543 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 		 543 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 		 543 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 		 568 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.22 
 
 		 554 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 		 543 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.22 
 
 		 546 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 		 554 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.75 
 
 		 554 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 		 543 aa  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 714 aa  89  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000759141  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 		 638 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.86 
 
 		 546 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 		 543 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.98 
 
 		 626 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0582  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.21 
 
 		 524 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  35.44 
 
 		 659 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  35.44 
 
 		 659 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1189  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.27 
 
 		 539 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  41.22 
 
 		 633 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.6 
 
 		 541 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  36.48 
 
 		 770 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  32.05 
 
 		 476 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.62 
 
 		 554 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4305  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 		 554 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0607  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 653 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100705 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  35.02 
 
 		 662 aa  88.2  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  37.19 
 
 		 651 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  31.72 
 
 		 706 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 		 546 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002443  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  30.26 
 
 		 541 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000057049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 		 541 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  37.42 
 
 		 545 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  43.14 
 
 		 236 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 		 540 aa  87.4  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  37.8 
 
 		 578 aa  87.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.76 
 
 		 563 aa  87.4  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  35.02 
 
 		 665 aa  87.4  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0583  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.38 
 
 		 524 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.344402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 554 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 554 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 		 706 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3447  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.38 
 
 		 524 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  43.7 
 
 		 650 aa  87.4  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 554 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>