More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2117 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2117  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 377 aa  767    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.47 
 
 		 380 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0668336  normal  0.991447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.47 
 
 		 380 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0952292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.21 
 
 		 380 aa  557  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  73.47 
 
 		 380 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.68 
 
 		 378 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.68 
 
 		 378 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.410986  normal  0.95878 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.29 
 
 		 378 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.894674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00410  methyl-accepting chemotaxis protein  37.93 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02270  putative chemotaxis transducer  31.2 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0260  putative chemotaxis transducer  30.56 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0724  chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 405 aa  166  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.77 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.386674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 414 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06142  chemotaxis protein  31.67 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0352354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01024  chemotaxis protein  31.67 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0730182  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0155  methyl-accepting chemotaxis protein  30.48 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.45 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.77 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3125  chemotaxis sensory transducer  26.94 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.443773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 535 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3111  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 535 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  38.99 
 
 		 549 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  37.18 
 
 		 549 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.97 
 
 		 688 aa  93.2  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 		 566 aa  93.2  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.56 
 
 		 573 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.95 
 
 		 549 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 699 aa  92  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 		 566 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.02 
 
 		 539 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1385  methyl-accepting chemotaxis protein  32.69 
 
 		 520 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 		 509 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 		 646 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1554  methyl-accepting chemotaxis protein  33.66 
 
 		 684 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  41.18 
 
 		 518 aa  90.1  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185607  normal  0.0170041 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0065  methyl-accepting chemotaxis protein  38.41 
 
 		 548 aa  90.1  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.826549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 		 852 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0916  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.18 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 		 673 aa  89.4  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.7 
 
 		 522 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  38.85 
 
 		 541 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.96 
 
 		 533 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.62 
 
 		 619 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002443  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  30.1 
 
 		 541 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000057049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.7 
 
 		 522 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.160306 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 		 549 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0789  chemotaxis sensory transducer  37.21 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.17 
 
 		 542 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.78 
 
 		 573 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 570 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.18 
 
 		 673 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.506738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 542 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.96 
 
 		 522 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.73 
 
 		 632 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  35.85 
 
 		 544 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1505  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 791 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 		 613 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.5 
 
 		 685 aa  87.8  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 		 541 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  39.69 
 
 		 578 aa  87.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  41.5 
 
 		 433 aa  87  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2678  methyl-accepting chemotaxis protein  35.96 
 
 		 533 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2443  putative chemotaxis transducer  36.13 
 
 		 531 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0524  methyl-accepting chemotaxis protein  42.36 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 		 465 aa  87.4  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0942  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 		 676 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 		 565 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 547 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.02 
 
 		 705 aa  87  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  34.22 
 
 		 541 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.02 
 
 		 630 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.97 
 
 		 544 aa  86.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28050  putative chemotaxis transducer  34.45 
 
 		 531 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 533 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 		 957 aa  86.7  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.578016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.98 
 
 		 514 aa  86.7  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 		 739 aa  86.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000403913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  34.16 
 
 		 560 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1223  methyl-accepting chemotaxis protein  34.5 
 
 		 381 aa  86.3  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  38.75 
 
 		 561 aa  86.3  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1197  chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 		 688 aa  86.3  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0331  methyl-accepting chemotaxis protein  30.6 
 
 		 578 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.46 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.97 
 
 		 658 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.751919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0740  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.46 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  45 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.79 
 
 		 638 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0086081  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.91 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3644  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.91 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>