More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00410 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00410  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 394 aa  795    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 		 384 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.61 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.38 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.894674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.34 
 
 		 378 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.410986  normal  0.95878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2117  methyl-accepting chemotaxis protein  37.93 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 		 380 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0668336  normal  0.991447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 		 380 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0952292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 		 380 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.16 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0724  chemotaxis sensory transducer  28.29 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.17 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02270  putative chemotaxis transducer  30.84 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0260  putative chemotaxis transducer  33.22 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.78 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.386674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06142  chemotaxis protein  30.12 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0352354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01024  chemotaxis protein  30.12 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0730182  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0155  methyl-accepting chemotaxis protein  29.36 
 
 		 384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.51 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3111  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  37.69 
 
 		 547 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2182  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.34 
 
 		 682 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000159481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 		 622 aa  93.6  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 		 546 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 331 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.03 
 
 		 666 aa  92.8  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with PAS/Pac sensor  30.7 
 
 		 518 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.185607  normal  0.0170041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.34 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2522  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.91 
 
 		 605 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000107886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.1 
 
 		 465 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  26.95 
 
 		 533 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  37.19 
 
 		 547 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 		 566 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.94 
 
 		 542 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.821346  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  37.19 
 
 		 547 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0662  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 		 626 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.436733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  27.03 
 
 		 533 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.34 
 
 		 576 aa  90.9  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886832 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 		 578 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3125  chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.443773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.74 
 
 		 566 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  27.22 
 
 		 533 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  37.19 
 
 		 547 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.49 
 
 		 556 aa  90.9  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3506  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 		 566 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.08 
 
 		 566 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.16 
 
 		 598 aa  89.7  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  39.47 
 
 		 622 aa  89.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  48.6 
 
 		 547 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.95 
 
 		 533 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3404  methyl-accepting chemotaxis protein  31.44 
 
 		 522 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2743  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  26.95 
 
 		 533 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.5 
 
 		 566 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  26.95 
 
 		 533 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 		 532 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.310324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.08 
 
 		 511 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1554  methyl-accepting chemotaxis protein  38.06 
 
 		 684 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2794  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 717 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  51.52 
 
 		 623 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.65 
 
 		 705 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3697  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 566 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.380844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 		 527 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.823637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  26.95 
 
 		 533 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  27.3 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.67 
 
 		 528 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0936318  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1267  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.91 
 
 		 728 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1967  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.91 
 
 		 728 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.29 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  50.51 
 
 		 587 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1813  methyl-accepting chemotaxis protein  37.91 
 
 		 728 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  35.76 
 
 		 578 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1294  methyl-accepting chemotaxis protein  50.52 
 
 		 663 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1794  methyl-accepting chemotaxis protein  37.91 
 
 		 644 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.061359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  26.95 
 
 		 533 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0410  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 		 548 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0995  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.93 
 
 		 517 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  51 
 
 		 553 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51 
 
 		 553 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  34.67 
 
 		 553 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51 
 
 		 553 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  35.96 
 
 		 706 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 		 673 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1025  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.91 
 
 		 570 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0126152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  33.02 
 
 		 553 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 		 572 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1006  methyl-accepting chemotaxis protein  31.46 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  36.07 
 
 		 663 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.58 
 
 		 605 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.053685  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  34.67 
 
 		 553 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  52.87 
 
 		 623 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.9 
 
 		 628 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00619864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  51 
 
 		 553 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  51 
 
 		 553 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  34.67 
 
 		 553 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  51 
 
 		 553 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 539 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1754  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.91 
 
 		 570 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0141  methyl-accepting chemotaxis domain-containing protein  37.91 
 
 		 521 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0779698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  34.67 
 
 		 553 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>