More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0260  putative chemotaxis transducer  88.49 
 
 		 391 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02270  putative chemotaxis transducer  100 
 
 		 390 aa  779    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0724  chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2117  methyl-accepting chemotaxis protein  31.12 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0668336  normal  0.991447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0952292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.34 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 		 406 aa  152  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.72 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.410986  normal  0.95878 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 		 378 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.894674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 		 384 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 396 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.386674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 		 331 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01024  chemotaxis protein  32.49 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0730182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00410  methyl-accepting chemotaxis protein  30.84 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06142  chemotaxis protein  32.49 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0352354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3125  chemotaxis sensory transducer  30.48 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.443773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0155  methyl-accepting chemotaxis protein  28.91 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0916  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.25 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3111  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.69 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0789  chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0602  methyl-accepting chemotaxis protein  34.88 
 
 		 536 aa  96.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  41.33 
 
 		 549 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0942  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.04 
 
 		 495 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000202207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  31.85 
 
 		 663 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 		 542 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1314  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 		 426 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 565 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.94 
 
 		 540 aa  90.5  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  36.73 
 
 		 545 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01599  hypothetical protein  35.29 
 
 		 483 aa  89.7  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  53.19 
 
 		 675 aa  89.4  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  45.16 
 
 		 544 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3519  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.55 
 
 		 514 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.86 
 
 		 544 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  33.61 
 
 		 535 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 		 646 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.457093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 		 570 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.8 
 
 		 695 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.07 
 
 		 549 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.8 
 
 		 541 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 		 537 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 		 572 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.26 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  47.83 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 		 640 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.72 
 
 		 705 aa  87  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.86 
 
 		 627 aa  87  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.09 
 
 		 700 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3697  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 566 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.380844 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 		 621 aa  86.7  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3506  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 566 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 		 566 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  31.08 
 
 		 626 aa  86.7  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 540 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  45.3 
 
 		 533 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 		 542 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.38 
 
 		 547 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  48.25 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 594 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3950  methyl-accepting chemotaxis transducer  40.14 
 
 		 725 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 		 676 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.53 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.21 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 559 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  31.58 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  34.57 
 
 		 695 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24370  methyl accepting chemotaxis sensory transducer  42.4 
 
 		 575 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0252866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.58 
 
 		 542 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  43.22 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.69 
 
 		 538 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.58 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 721 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.53 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 525 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0331  methyl-accepting chemotaxis protein  31.48 
 
 		 578 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.6 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.55 
 
 		 707 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  28.33 
 
 		 653 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 557 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.64 
 
 		 622 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  37.25 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.86 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  35.44 
 
 		 660 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  29.09 
 
 		 674 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3293  chemotaxis sensory transducer  37.16 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  34.48 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2372  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 		 657 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.63052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.27 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  36.6 
 
 		 600 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001512  aerotaxis sensor receptor protein  36.42 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.961146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4936  methyl-accepting chemotaxis protein  46.43 
 
 		 644 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 		 705 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 706 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>