More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0724 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0724  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
405 aa  809    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0260  putative chemotaxis transducer  33.77 
 
 
391 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02270  putative chemotaxis transducer  36.39 
 
 
390 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319109  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2117  methyl-accepting chemotaxis protein  33.85 
 
 
377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 
384 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.26 
 
 
378 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.410986  normal  0.95878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 
396 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.386674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
378 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 
380 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0668336  normal  0.991447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 
380 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0952292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 
380 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.465964  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33 
 
 
378 aa  156  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.894674  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 
380 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 
406 aa  153  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.89 
 
 
331 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06142  chemotaxis protein  30.46 
 
 
366 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0352354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01024  chemotaxis protein  30.46 
 
 
366 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0730182  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 
414 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00410  methyl-accepting chemotaxis protein  28.29 
 
 
394 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3125  chemotaxis sensory transducer  26.52 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.443773  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0155  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3111  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 
397 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.84 
 
 
545 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0602  methyl-accepting chemotaxis protein  46.45 
 
 
536 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  36.63 
 
 
698 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3236  methyl-accepting chemotaxis protein  30.42 
 
 
544 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.1 
 
 
546 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000496  methyl-accepting chemotaxis protein  51.85 
 
 
520 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232366  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06258  hypothetical protein  45.07 
 
 
520 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  43.51 
 
 
682 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0916  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.25 
 
 
404 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  27.11 
 
 
545 aa  94  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.95 
 
 
545 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.95 
 
 
545 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.52 
 
 
541 aa  93.6  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  39.9 
 
 
418 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  36.68 
 
 
706 aa  93.2  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0143  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 
539 aa  93.2  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.92 
 
 
630 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.84 
 
 
545 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.84 
 
 
545 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.48 
 
 
545 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
568 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.31 
 
 
548 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 
648 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.89 
 
 
522 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.89 
 
 
522 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 
520 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  38.92 
 
 
720 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  28.66 
 
 
708 aa  91.3  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  45.74 
 
 
559 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  39.87 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.41 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.9 
 
 
658 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1963  chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 
535 aa  91.3  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 
554 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.89 
 
 
522 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1621  methyl-accepting chemotaxis protein  39.75 
 
 
513 aa  90.9  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0789  chemotaxis sensory transducer  37.42 
 
 
405 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
676 aa  90.9  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02244  hypothetical protein  32.25 
 
 
672 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0584  methyl-accepting chemotaxis protein  31.64 
 
 
524 aa  90.5  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.32 
 
 
627 aa  90.5  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 
650 aa  90.5  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.48 
 
 
545 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.48 
 
 
545 aa  90.5  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4711  methyl-accepting chemotaxis protein  36.22 
 
 
633 aa  90.1  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 
631 aa  90.1  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.75 
 
 
688 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.14 
 
 
540 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2432  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.15 
 
 
555 aa  90.1  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0013651  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  38.65 
 
 
714 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
712 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 
560 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.19 
 
 
580 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  25 
 
 
622 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  32.59 
 
 
539 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  43.9 
 
 
557 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  43.18 
 
 
561 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4927  methyl-accepting chemotaxis protein/sensory box protein  63.01 
 
 
511 aa  89.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  27.62 
 
 
770 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  39.89 
 
 
547 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  38.65 
 
 
714 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  58.82 
 
 
511 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  39.6 
 
 
623 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.72 
 
 
647 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  43.18 
 
 
561 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00866  hypothetical protein  33.07 
 
 
418 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.5 
 
 
673 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  40.24 
 
 
688 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  43.85 
 
 
545 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  38.89 
 
 
523 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  31.05 
 
 
578 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  45 
 
 
545 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3293  chemotaxis sensory transducer  28.44 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0583  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  36.76 
 
 
524 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.344402 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  44 
 
 
578 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 
688 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
773 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 
564 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>