More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02244 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02244  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1370    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003516  methyl-accepting chemotaxis protein  75.07 
 
 		 672 aa  1022    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0337071  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1141  methyl-accepting chemotaxis protein  53.89 
 
 		 673 aa  696    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0337081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  30 
 
 		 663 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01518  hypothetical protein  25.87 
 
 		 674 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  26.92 
 
 		 543 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1007  hemolysin secretion protein HylB  31.16 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.702356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.54 
 
 		 541 aa  142  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  25.62 
 
 		 672 aa  141  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.72 
 
 		 653 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  28.69 
 
 		 653 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.3 
 
 		 671 aa  140  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  28.53 
 
 		 536 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 549 aa  138  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  28.71 
 
 		 652 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03783  Methyl-accepting chemotaxis protein (PAS/PAC and MSP doamins)  36.61 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 		 546 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.83 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1937  methyl-accepting chemotaxis protein  31.48 
 
 		 662 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.51 
 
 		 653 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 654 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.17 
 
 		 637 aa  134  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  31.83 
 
 		 587 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 		 621 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 		 543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  26.33 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 646 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  31.25 
 
 		 639 aa  132  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.91 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3892  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 646 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.176231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 		 533 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.77 
 
 		 533 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 636 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 		 543 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  34.15 
 
 		 628 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 		 543 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.61 
 
 		 677 aa  130  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  30.5 
 
 		 542 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000502  methyl-accepting chemotaxis protein  31.78 
 
 		 589 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.567249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.79 
 
 		 543 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.72 
 
 		 573 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.77 
 
 		 650 aa  130  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05097  sensor protein TorS  30.95 
 
 		 542 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  30.75 
 
 		 549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  28.61 
 
 		 546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  32.49 
 
 		 639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1963  chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.32 
 
 		 573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 		 554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  31.96 
 
 		 628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 		 605 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  31.88 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 		 620 aa  129  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 646 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.37 
 
 		 620 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 		 638 aa  129  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.81 
 
 		 657 aa  128  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  30.47 
 
 		 539 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.5 
 
 		 773 aa  128  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  30.82 
 
 		 645 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.66 
 
 		 638 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  30.79 
 
 		 636 aa  128  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  29.04 
 
 		 672 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.7 
 
 		 552 aa  127  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 		 636 aa  127  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.34 
 
 		 695 aa  127  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  30.28 
 
 		 712 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  30.7 
 
 		 642 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  29.94 
 
 		 553 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  27.35 
 
 		 547 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0789  chemotaxis sensory transducer  29.14 
 
 		 676 aa  127  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.7 
 
 		 638 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 674 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4057  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.07 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.79 
 
 		 533 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.7 
 
 		 638 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.411591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.32 
 
 		 700 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.3 
 
 		 658 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 		 620 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0279  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.7 
 
 		 638 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.983838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  27.76 
 
 		 712 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5554  methyl-accepting chemotaxis protein  26.74 
 
 		 676 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1539  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.68 
 
 		 626 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206608  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3425  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.34 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146645  hitchhiker  0.000433 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.28 
 
 		 620 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 		 638 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666265  normal  0.186245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.53 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0282  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.7 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  30.06 
 
 		 627 aa  126  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  29.56 
 
 		 627 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  29.87 
 
 		 647 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.1 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.09 
 
 		 646 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0815522  normal  0.369158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 		 620 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 		 638 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  29.14 
 
 		 714 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0272  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.28 
 
 		 638 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00090491  hitchhiker  0.000000349734 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 		 540 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.28 
 
 		 638 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.758035  hitchhiker  0.0000678809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05646  histidine kinase  30.7 
 
 		 482 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>