More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0260 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0260  putative chemotaxis transducer  100 
 
 		 391 aa  785    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02270  putative chemotaxis transducer  88.49 
 
 		 390 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0724  chemotaxis sensory transducer  33.77 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2368  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.89 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0668336  normal  0.991447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0952292  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2117  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2094  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.12 
 
 		 380 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.79 
 
 		 378 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.410986  normal  0.95878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.5 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.49 
 
 		 384 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.894674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1917  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.386674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01024  chemotaxis protein  33.44 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0730182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06142  chemotaxis protein  33.44 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0352354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.52 
 
 		 331 aa  139  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00410  methyl-accepting chemotaxis protein  33.22 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3125  chemotaxis sensory transducer  29.14 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.443773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0155  methyl-accepting chemotaxis protein  29.64 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3111  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.53 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0916  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  34.77 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.8 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0602  methyl-accepting chemotaxis protein  34.41 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0789  chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  41.18 
 
 		 549 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0942  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.54 
 
 		 495 aa  92.8  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000202207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  32.55 
 
 		 770 aa  90.9  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  32.56 
 
 		 695 aa  89.7  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  28.84 
 
 		 584 aa  89.7  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 640 aa  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  37.8 
 
 		 593 aa  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  31.18 
 
 		 600 aa  89  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 		 542 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1314  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  32.25 
 
 		 535 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3519  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  29.84 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1251  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.89 
 
 		 646 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.457093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.18 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.93 
 
 		 554 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  37.34 
 
 		 660 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2638  chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 		 675 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01599  hypothetical protein  35.29 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  44.8 
 
 		 544 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3533  methyl-accepting chemotaxis protein  37.34 
 
 		 660 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2831  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.8 
 
 		 554 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 572 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 		 621 aa  87.8  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  28.89 
 
 		 653 aa  87.8  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0016  methyl-accepting chemotaxis protein  36.08 
 
 		 660 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 		 549 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  38.69 
 
 		 545 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3928  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0381979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 		 565 aa  87.4  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1602  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.87 
 
 		 554 aa  87  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0524  methyl-accepting chemotaxis protein  39.23 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.69 
 
 		 538 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.58 
 
 		 542 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  34.08 
 
 		 541 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 		 677 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  36.08 
 
 		 650 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24370  methyl accepting chemotaxis sensory transducer  42.4 
 
 		 575 aa  87  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0252866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.03 
 
 		 554 aa  86.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 537 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.75 
 
 		 544 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.04 
 
 		 550 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 699 aa  86.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 525 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  40.88 
 
 		 663 aa  86.3  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0206  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 425 aa  86.3  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3697  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.380844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.41 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  32.42 
 
 		 541 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 762 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.463366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1571  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 		 557 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  28.96 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.93 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.164628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4936  methyl-accepting chemotaxis protein  46.43 
 
 		 644 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3506  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.3 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001512  aerotaxis sensor receptor protein  36.24 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.961146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 		 570 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  28.96 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 706 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.01 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 706 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 706 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 		 631 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  44.25 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0613025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.31 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.86 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.802205  normal  0.183546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.64 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 		 700 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>