More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1571 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1571  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 362 aa  725    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0916  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  38.31 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0789  chemotaxis sensory transducer  38.31 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3293  chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1314  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.79 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116934  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.97 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.827974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1537  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 		 377 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0414655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 621 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022904  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3261  chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 534 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 		 602 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  37.56 
 
 		 533 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.09 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.54 
 
 		 583 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.22 
 
 		 589 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 		 664 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0724  chemotaxis sensory transducer  31.7 
 
 		 405 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 550 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0613025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.11 
 
 		 650 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 		 660 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.31 
 
 		 864 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0260  putative chemotaxis transducer  32.97 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  32.88 
 
 		 658 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 530 aa  92  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3326  chemotaxis sensory transducer  38.85 
 
 		 534 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.16 
 
 		 563 aa  91.7  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 		 660 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 		 660 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  38.12 
 
 		 566 aa  91.3  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.19 
 
 		 555 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.09 
 
 		 564 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 679 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0977353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  38.56 
 
 		 658 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 566 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  38.56 
 
 		 658 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  38.56 
 
 		 658 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  41.44 
 
 		 626 aa  90.5  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.26 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 		 658 aa  90.9  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  38.26 
 
 		 658 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  34.32 
 
 		 653 aa  90.9  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  44.64 
 
 		 660 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  44.64 
 
 		 660 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.3 
 
 		 414 aa  90.1  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.48 
 
 		 545 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  44.64 
 
 		 660 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  44.64 
 
 		 660 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.62 
 
 		 566 aa  90.1  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 660 aa  90.1  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  35.33 
 
 		 658 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 		 366 aa  89.7  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.62 
 
 		 660 aa  90.1  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.4 
 
 		 528 aa  89.7  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  40.26 
 
 		 658 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  40.26 
 
 		 658 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0594  methyl-accepting chemotaxis protein  35.05 
 
 		 314 aa  89.7  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  40.26 
 
 		 658 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0684  methyl-accepting chemotaxis protein  43.69 
 
 		 314 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.74 
 
 		 695 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0751  methyl-accepting chemotaxis protein  43.69 
 
 		 314 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0739  methyl-accepting chemotaxis protein  43.69 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81832e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4621  methyl-accepting chemotaxis protein  43.69 
 
 		 313 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000649403 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0650  methyl-accepting chemotaxis protein  43.69 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0595  methyl-accepting chemotaxis protein  43.69 
 
 		 314 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  33.16 
 
 		 660 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 613 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3665  chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 567 aa  89.4  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0811  methyl-accepting chemotaxis protein  43.69 
 
 		 314 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0715  methyl-accepting chemotaxis protein  43.69 
 
 		 313 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 708 aa  89.4  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.34 
 
 		 550 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.69 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 524 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3060  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 		 659 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.471114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1294  methyl-accepting chemotaxis protein  35.54 
 
 		 663 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.148925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.12 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  41.09 
 
 		 700 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  41.09 
 
 		 700 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  36.25 
 
 		 650 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 		 614 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  36.25 
 
 		 650 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 		 951 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143462  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  33.73 
 
 		 678 aa  88.2  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.76 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02270  putative chemotaxis transducer  31.38 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  46.36 
 
 		 538 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.2 
 
 		 658 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  45.45 
 
 		 535 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 658 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  41.09 
 
 		 700 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03238  chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.27 
 
 		 598 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  38.82 
 
 		 656 aa  87.8  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 		 523 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.429585  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.09 
 
 		 652 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 		 682 aa  87.4  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0300  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 585 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0762  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 		 484 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.32 
 
 		 484 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.41 
 
 		 963 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>