More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05136 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  87.02 
 
 
547 aa  954    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0070  methyl-accepting chemotaxis protein  63.62 
 
 
547 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.740118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  100 
 
 
558 aa  1115    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05097  sensor protein TorS  47.53 
 
 
542 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001231  methyl-accepting chemotaxis protein  47.9 
 
 
542 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.554422  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  47.98 
 
 
561 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0712  methyl-accepting chemotaxis citrate transducer  46.01 
 
 
546 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  40.69 
 
 
543 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0771  methyl-accepting chemotaxis protein  40.23 
 
 
661 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 
543 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.75882  hitchhiker  0.00000661881 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  43.67 
 
 
543 aa  220  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  30.54 
 
 
541 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 
541 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 
638 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 
713 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 
543 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  36.97 
 
 
712 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  36.69 
 
 
712 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 
541 aa  206  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  38.66 
 
 
546 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 
716 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  36.96 
 
 
642 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.91 
 
 
541 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 
653 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
541 aa  203  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 
540 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  35.48 
 
 
541 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.81 
 
 
544 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 
642 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 
541 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 
637 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  35.88 
 
 
676 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  38.94 
 
 
541 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  36.8 
 
 
672 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.75 
 
 
542 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
674 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  36 
 
 
549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.82 
 
 
547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.52 
 
 
681 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 
550 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  38.11 
 
 
539 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 
539 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  43.96 
 
 
547 aa  197  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  34.19 
 
 
541 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  37.85 
 
 
543 aa  197  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 
541 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  34.83 
 
 
545 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 
541 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.35 
 
 
541 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.28 
 
 
636 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 
541 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 
541 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.87 
 
 
541 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 
425 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
546 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 
541 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.69 
 
 
540 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 
619 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 
541 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
541 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 
637 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  35.85 
 
 
633 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
541 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
541 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.94 
 
 
531 aa  193  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
634 aa  193  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.68 
 
 
541 aa  193  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.28 
 
 
539 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.1 
 
 
411 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 
547 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.46 
 
 
555 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.64 
 
 
541 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.48 
 
 
640 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.39 
 
 
539 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.24 
 
 
545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 
541 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.84 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  33.41 
 
 
652 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 
661 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  35.53 
 
 
545 aa  191  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
541 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.89 
 
 
634 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 
650 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.22 
 
 
700 aa  190  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
541 aa  190  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.64 
 
 
533 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 
541 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.53 
 
 
540 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  32.6 
 
 
553 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 
533 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  36.87 
 
 
714 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.23 
 
 
640 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 
715 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 
679 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  31.98 
 
 
544 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
573 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 
539 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  39.2 
 
 
569 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>